Package: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-2)

[ Source: tvc  ]

Genetisk variantkalder for Ion Torrent-sekventeringsplatforme

Torrent Variant Caller (TVC) er en genetisk variantkalder for Ion Torrent-sekventeringsplatforme og er specielt optimeret til at udnytte den underliggende flydende signalinformation i den statistiske model til at evaluere varianter. Torrent Variant Caller er designet til at kalde enkeltnukleotid polymorfier (SNP'er), flernukleotid polymorfier (MNP'er), indsættelser, sletninger og blokere substitutioner.

Other Packages Related to tvc

• dep: libarmadillo9 (>= 1:9.200.6+dfsg)

  streamlined C++ linear algebra library

• dep: libbamtools2.5.1

  Dynamisk bibliotek til at manipulere BAM-filer (genomsammenligning)

• dep: libblas3

  Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis2-openmp, libblis2-pthread, libblis2-serial, libopenblas-base

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  Bibliotek for entropimåling af bytestrømme

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libjsoncpp1 (>= 1.7.4)

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: liblapack3

  Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas-base

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  Bestem lignende regioner mellem to strenge eller genomsekvenser - bibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python

  Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download tvc

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1,033.9 kB	3,316.0 kB	[list of files]