Package: pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-1)

[ Source: pbsim  ]

Simulator for PacBio-sekvenslæsninger

PacBio DNA-sekvensopbyggere fremstiller to typer af karakteristiske læsninger: CCS (kort og lav fejlrate) og CLR (lang og høj fejlrate), begge kan være nyttige for de novo-samling af genomer. PBSIM simulerer disse PacBio-læsninger fra en referencesekvens ved at brug enten en modelbaseret eller prøvebaseret simulering. Simulerede læsninger er nyttige, for eksempel, når udvikling eller evaluerende sekvenssamlinger målrettet PacBio-data.

Tags: Biology: Nucleic Acids, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Role: Program, Purpose: use::simulating, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to pbsim

• dep: libc6 (>= 2.14)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download pbsim

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	24.8 kB	97.0 kB	[list of files]