Package: sprai (0.9.9.23+dfsg1-2)

[ Source: sprai  ]

Forbedring af single-pass-sekventeringslæsenøjagtighed

Sprai er et værktøj til at rette sekventeringsfejl i single-pass- læsninger for de novo-samling. Det er oprindeligt designet for rettelse af sekventeringsfejl i enkelt molekyle DNS-sekventeringslæsninger, specielt i Continous Long Reads (CLR'er) oprettet af PacBio RS- sekvensprogrammer. Formålet med Sprai er ikke at maksimere præcisionen for fejlrettede læsninger. I stedet forsøger Sprai at maksimere kontinuiteten (dvs., N50 contig-længder) for samlede contig'er efter fejlrettelse.

Other Packages Related to sprai

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [not arm64, ppc64el]

• dep: ncbi-blast+

  Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

• dep: time

  GNU's tidsprogram til måling af cpu-ressourceforbrug

• sug: make

  Redskab til at dirigere kompileringen

• sug: pbalign

  Package not available

• sug: pbgenomicconsensus

  Package not available

• sug: pbh5tools

  Package not available

Download sprai

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1,475.9 kB	1,706.0 kB	[list of files]
arm64	1,473.9 kB	1,694.0 kB	[list of files]
armel	1,473.3 kB	1,686.0 kB	[list of files]
armhf	1,471.6 kB	1,666.0 kB	[list of files]
i386	1,477.0 kB	1,710.0 kB	[list of files]
mips64el	1,476.7 kB	1,705.0 kB	[list of files]
mipsel	1,475.9 kB	1,690.0 kB	[list of files]
ppc64el	1,477.6 kB	1,882.0 kB	[list of files]
s390x	1,473.9 kB	1,698.0 kB	[list of files]