Package: simkamin (1.5.3-4)

[ Source: simka  ]

Omtrentlig komparativ metagenomikmetode dedikeret til NGS-datasæt

Simka er et de nove-komparativt metagenom-værktøj. Simka repræsenterer hvert datasæt som et k-mer-spektrum og beregner flere klassiske økologiske afstande mellem dem.

Forskellen til Simka består i at SimkaMin fremstiller omtrentlige (men meget lig) resultater ved at undersample kmer-rummet. Med denne strategi og med stadardparametre er SimkaMin væsentlig hurtigere, bruger 10 gange mindre hukommelse og 70 gange mindre diskplads end Simka.

Other Packages Related to simkamin

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

Download simkamin

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	31.3 kB	385.0 kB	[list of files]