Package: gasic (0.0.r19-7)

[ Source: gasic  ]

Lighedskorrektion for arvemasseoverflod

Et mål for sekvensbaseret metagenomisk analyse er den kvantitative taksonomiske vurdering af mikrobielle miljøsammensætninger. Imidlertid er flertallet af indgangsvinklerne enten kvantificer ved lav opløsning (f.eks. på rækkeniveau) eller de har alvorlige problemer angående meget lignende arter. Alligevel er nøjagtig kvantificering på artsniveau ønskelig i anvendelser såsom metagenomisk diagnostik eller fællesskabssammenligning. GASiC er en metode til at korrigere læste justeringsresultater for de uklarheder, der indførtes ved ligheder i arvemasser. Metoden har overlegen ydelse i forhold til eksisterende metoder.

Other Packages Related to gasic

• dep: bowtie

  Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

• dep: bowtie2

  Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

• dep: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-biopython

  Python 3-bibliotek for bioinformatik

• dep: python3-matplotlib

  Pythonbaseret plotsystem i en stil svarende til Matlab - Python 3

• dep: python3-numpy

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• dep: python3-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python 3

• dep: seqan-apps

  C++-bibliotek for analyse af biologiske sekvenser

• sug: gasic-examples

  Lighedskorrektion for arvemasseoverflod - dataeksempler

Download gasic

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	20.5 kB	81.0 kB	[list of files]