Package: bio-vcf (0.9.5-2)

[ Source: bio-vcf  ]

Domain specific language (DSL) for behandling af VCF-formatet

Bio-vcf tilbyder et domænespecifikt sprog (DSL) for behandling af VCF-formatet. Record-navnefelter kan forespørges med gængse udtryk, f.eks.:

 sample.dp>20 and rec.filter !~ /LowQD/ and rec.tumor.bcount[rec.alt]>4

Bio-vcd er en ny generation VCF-fortolker, filter og konverteringsprogram. Bio-vcf er ikke kun meget hurtig til genome-wide (WGS) data, det har også et rigtigt fint filtrerings-, evaluerings- og omskrivningssprog og det kan som resultat lave enhver type tekstdata, inklusive VCF-teksthoveder og indhold i RDF og JSON.

Other Packages Related to bio-vcf

• dep: ruby

  Fortolker af det objektorienterede skriptsprog Ruby - standardversion

  or ruby-interpreter

  Package not available

Download bio-vcf

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	25.1 kB	119.0 kB	[list of files]