Package: seqprep-data (1.3.2-5)

[ Source: seqprep  ]

Eksempler på datasæt for seqprep - kun til test

SeqPrep er et program til at sammenlægge parrede Illuminalæsninger, der overlapper hinanden ind i en enkelt længere læsning. Det kan også bruges til sin adaptertilpasningsfunktion uden at udføre nogen parrede slut-overlapninger. Når en adaptersekvens er nuværende, det betyder, at de to læsninger skal overlappe (i de fleste tilfælde) så de er kraftigt fusioneret. Når læsninger ikke har adaptersekvens, skal de behandles omhyggeligt, når man laver sammenføjningen, så en langt mere specifik fremgangsmåde er valgt. Standardparametrene blev valgt med tanke på specificitet, så at de kunne køres på biblioteker, hvor meget få læsninger forventes at overlappe hinanden. Det er dog altid sikreste at gemme den overlappende procedure for biblioteker, hvor du har forudgående kendskab til, at en væsentlig del af læsningerne vil have overlapning.

Denne pakke er ikke krævet for normal operation af seqprep. Den leverer bare nogle testdata samt et testskript.

Other Packages Related to seqprep-data

• dep: seqprep

  Strippe adaptere og/eller sammenføjede parrede læsninger af DNA-sekvenser med overlap

Download seqprep-data

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	35,019.6 kB	35,906.0 kB	[list of files]