all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: alien-hunter  ]

Package: alien-hunter (1.7-8)

Links for alien-hunter

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package alien-hunter:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Interpolated Variable Order Motifs til identificering af vandret indsamlede DNA

Alien_hunter er et program til forudsigelse af begivenheder af formodede Horisontal Gentransfer (HGT) med implementeringen af Interpolated Variable Order Motifs (IVOMs). En IVOM-tilgang udnytter kompositionelle tilbøjelighed med brug af variable »order motif«-distributioner og indfanger mere pålideligt den lokale komposition af en sekvens, sammenlignet med »fixed-order«-metoder. Alternativt kan forudsigelserne fortolkes til 2. tilstands, 2. orden Hidden Markov Model (HMM), i et change-point detekteringsrammeværk, for at optimiere lokaliseringen af grænserne for de forudsagte regioner. Forudsigelserne (embl-format) kan indlæses i Artemis genom-viser automatisk, der er frit tilgængelig på: http://www.sanger.ac.uk/Software/Artemis/.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: implemented-in::java, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Analysing

Other Packages Related to alien-hunter

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download alien-hunter

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
all 27.6 kB112.0 kB [list of files]