Package: mhap (2.1.3+dfsg-3)

[ Source: mhap  ]

Lokalitetsfølsom hashing for at registrere long-read-overlap

MinHash Alignment Process (MHAP--pronounced MAP) er en referenceimplementering af en overlappende probabilistisk sekvensalgoritme. Designet til effektivt at registrere alle overlap mellem støjende long-read sekvensdata. Det estimerer effektivt Jaccard-lighed ved at komprimere sekvenser til deres repræsentative fingeraftryk sammensat på min-mers (minimum k-mer).

Other Packages Related to mhap

• dep: default-jre-headless

  Standardjava eller Javakompatibel kørselstid - uden skærm

• dep: jaligner

  Smith-Waterman-algoritme med Gotohs forbedring

• dep: jarwrapper

  Kør kørbare Java .jar-filer

• dep: libcommons-compress-java

  Java API for arbejde med komprimerings- og arkivformater

• dep: libfastutil-java

  Java API providing type-specific maps, sets, lists and queues

• dep: libguava-java (>= 19)

  Suite of Google common libraries for Java

• dep: libssw-java

  Javabindinger for libssw

Download mhap

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	156.5 kB	192.0 kB	[list of files]