Package: libjellyfish-2.0-dev (2.3.0-10)
Links for libjellyfish-2.0-dev
Debian Resources:
Download Source Package jellyfish:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Shaun Jackman (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
External Resources:
- Homepage [www.cbcb.umd.edu]
Similar packages:
Tæl k-mers i DNA-sekvenser - udviklingsfiler for jellyfish
JELLYFISH er et værktøj for hurtig, hukommelseseffektiv optælling af k-mers i DNA. En k-mer er en understreng med længden k, og optælling af forekomsterne af alle sådanne understrenge er et centralt trin i mange analyser af DNA-sekvenser. JELLYFISH kan optælle k-mers via en i størrelsesorden mindre brug af hukommelse og via en i størrelsesorden større hurtighed end andre k-mer optællingspakker ved at bruge en effektiv kodning af en hashtabel og ved at udnytte cpu-instruktionen »compare-and- swap« til at øge parallelisme.
JELLYFISH er et program for kommandolinjen, som læser FASTA- og multi- FASTA-filer indeholdende DNA-sekvenser. Den fremstiller sin k-mer- optælling i et binært format, som kan oversættes til et læsevenligt tekstformat via kommandoen »jellyfish dump«.
Denne pakke indeholder udviklingsfilerne (statisk bibliotek og teksthovedfiler).
Other Packages Related to libjellyfish-2.0-dev
|
|
|
|
-
- dep: libjellyfish-2.0-2 (= 2.3.0-10)
- Tæl k-mers i DNA-sekvenser - dynamisk bibliotek for jellyfish
Download libjellyfish-2.0-dev
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 134.3 kB | 697.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 132.4 kB | 688.0 kB | [list of files] |
| armel | 129.1 kB | 620.0 kB | [list of files] |
| armhf | 129.3 kB | 591.0 kB | [list of files] |
| i386 | 141.6 kB | 641.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 141.8 kB | 789.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 142.6 kB | 740.0 kB | [list of files] |