Package: libgkarrays1 (2.1.0+dfsg-4)

[ Source: libgkarrays  ]

Bibliotek til at forespørge en stor samling af NGS-sekvenser

Gk-arrays tilbydes som et simpelt C++-bibliotek dedikeret til forespørgsler på en stor samling af sekvenser som fremstillet af høj-gennemløb sekventeringsprogrammer (f.eks. HiSeq 2000 fra Illumina, 454 fra Roche).

Gk-arrays indekserer k-mers med læsninger og gør, at man kan besvare forskellige forespørgsler på den læste samling (f.eks. hvor mange læsninger deler denne k-mer? hvor fremgår denne k-mer i den læste samling?).

Gk-arrays består af et pladseffektivt alternativ til hash-tabeller mens det er lignende i form af forespørgselstider.

Tags: Role: Shared Library

Other Packages Related to libgkarrays1

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, mipsel]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download libgkarrays1

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	55.4 kB	171.0 kB	[list of files]
arm64	51.3 kB	154.0 kB	[list of files]
armel	51.7 kB	142.0 kB	[list of files]
armhf	50.7 kB	126.0 kB	[list of files]
i386	61.9 kB	178.0 kB	[list of files]
mips64el	55.0 kB	180.0 kB	[list of files]
mipsel	60.8 kB	177.0 kB	[list of files]
ppc64el	58.1 kB	243.0 kB	[list of files]
s390x	51.9 kB	166.0 kB	[list of files]