Package: iqtree (1.6.12+dfsg-1)

[ Source: iqtree  ]

Effektivt fylogenetisk program ved maksimal sandsynlighed

IQ-TREE er et meget effektivt maksimal sandsynlighedsfylogenetisk program med følgende nøglefunktioner blandt flere:

 * En hidtil ukendt hurtig og effektiv stokastisk algoritme til at
   estimere maksimale sandsynlighedstræer. IQ-TREE overgår både RAxML
   og PhyML i form af sandsynlighed, men kræver tilsvarende mængde
   beregning (se Nguyen et al., 2015)
 * En ultrahurtig bootstrap-tilnærmelse til at vurdere branchestøtter
   (se Minh et al., 2013)
 * En bred vifte af substitutionsmodeller for binær, DNA, protein, codon,
   og morfologiske tilpasninger
 * Ultrahurtig model valg for alle datatyper, 10 til 100 gange hurtigere
   end jModelTest og ProtTest
 * Find bedste partitionsskema ligesom PartitionFinder
 * Partitioneret modeller med blandede datatyper for fylogenetiske
   (multigenfamilier) sammenligninger, der giver mulighed for separate,
   proportionale, eller fælles grenlængder blandt gener
 * Støtte til fylogenetisk sandsynlighedsbibliotek (PLL) (se Flouri et
   al., 2014)

Other Packages Related to iqtree

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.0) [amd64]

  Package not available

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.2)

  Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download iqtree

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2,749.0 kB	18,804.0 kB	[list of files]
i386	2,534.2 kB	17,074.0 kB	[list of files]