Package: r-bioc-degreport (1.26.0+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-degreport  ]

BioConductor - rapport over DEG-analyser

Oprettelse af en HTML-rapport for differentielt udtryksanalyse af count-data. Integrerer noget af koden nævnt i DESeq2 og edgeR-vignetter og rapporterer en rangeret liste af gener jævnfør fold-ændringernes gennemsnit og variabilitet for hvert valgt gen.

Other Packages Related to r-bioc-degreport

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.12

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-bioc-biobase

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-complexheatmap

  Lav komplekse varmekort via GNU R

• dep: r-bioc-consensusclusterplus

  GNU R-bestemmelse af klyngeantal og medlemskab

• dep: r-bioc-deseq2

  R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

• dep: r-bioc-edger

  Empirisk analyse af digitale gen-udtryksdata i R

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor - assay-container

• dep: r-cran-broom

  convert statistical analysis objects into tidy data frames with GNU R

• dep: r-cran-circlize

  Circular Visualization

• dep: r-cran-cluster

  GNU R-pakke for klyngeanalyse af Rousseeuw et al

• dep: r-cran-cowplot

  GNU R streamlined plot theme and plot annotations for 'ggplot2'

• dep: r-cran-dplyr

  GNU R-grammatik for datamanipulering

• dep: r-cran-ggdendro

  GNU R create dendrograms and tree diagrams using 'ggplot2'

• dep: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-ggrepel

  Automatisk positionering ikkeoverlappende tekstetiketter i plot

• dep: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• dep: r-cran-lasso2

  GNU R L1-begrænset estimering a.k.a. »lasso«

• dep: r-cran-logging

  GNU R-logningspakke

• dep: r-cran-magrittr

  GNU R - operatør for fremadrettet datakanal

• dep: r-cran-nozzle.r1

  GNU R nozzle reports

• dep: r-cran-psych

  GNU R-procedurer for psykologisk, psykometrisk og personlighedsforskning

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R-pakke der tilbyder egnede farvepaletter

• dep: r-cran-reshape

  Flexibly reshape data

• dep: r-cran-rlang

  Funktioner for basistyper samt Core R- og »Tidyverse«-funktioner

• dep: r-cran-scales

  Skaler funktioner for visualisering

• dep: r-cran-stringr

  Gør det nemmere at arbejde med strenge

• dep: r-cran-tibble

  GNU R - simple datarammer

• dep: r-cran-tidyr

  GNU R-pakke til nemt at rydde op i data

• rec: r-cran-testthat

  GNU R-testpakke

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-limma

  Lineære modeller for microarray-data

• sug: r-cran-pheatmap

  GNU R-pakke til at oprette smukke varmekort

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-statmod

  GNU R package providing algorithms and functions for statistical modeling

Download r-bioc-degreport

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	1,815.8 kB	1,975.0 kB	[list of files]