all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]
[ Source: r-cran-alakazam  ]

Package: r-cran-alakazam (1.1.0-1)

Links for r-cran-alakazam

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package r-cran-alakazam:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Immunoglobulin Clonal Lineage og Diversity Analysis

Alakazam er en del af Immcantation-analyserammen for Adaptive Immune Receptor Repertoire-sekventering (AIRR-seq) og tilbyder et sæt af værktøjer til at undersøge lymfocytreceptor klonale linjer, diversitet, genbrug og andre repertoire-niveauegenskaber med fokus på høj-gennemløb immunoglobulin -sekventering (Ig).

Alakazam har fem hovedformål:

 * Tilbyder grundlæggende funktionalitet for andre R-pakker i rammen
   Immcantation. Dette inkluderer gængse opgaver såsom fil-I/O,
   grundlæggende DNA-sekvensmanipulering og interaktion med V(D)J-segment
   og genannoationer
 * Tilbyder en R-grænseflade til interaktion med resultatet af pRESTO- og
   Change-O-værktøjspakkerne
 * Udfører afstamningsrekonstruktion på klonale populationer af Ig-
   sekvenser og analyserer topologien af ​​de resulterende afstamningstræer
 * Udførelse af klonal overflods- og diversitetsanalyse på lymfocyt-
   repertoirer
 * Udførelse af fysisk-kemiske egenskabsanalyser af lymfocytreceptor-
   sekvenser

Other Packages Related to r-cran-alakazam

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download r-cran-alakazam

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
i386 2,486.4 kB2,942.0 kB [list of files]