[ Source: r-cran-alakazam ]
Package: r-cran-alakazam (1.1.0-1)
Links for r-cran-alakazam
Debian Resources:
Download Source Package r-cran-alakazam:
- [r-cran-alakazam_1.1.0-1.dsc]
- [r-cran-alakazam_1.1.0.orig.tar.gz]
- [r-cran-alakazam_1.1.0-1.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [cran.r-project.org]
Similar packages:
Immunoglobulin Clonal Lineage og Diversity Analysis
Alakazam er en del af Immcantation-analyserammen for Adaptive Immune Receptor Repertoire-sekventering (AIRR-seq) og tilbyder et sæt af værktøjer til at undersøge lymfocytreceptor klonale linjer, diversitet, genbrug og andre repertoire-niveauegenskaber med fokus på høj-gennemløb immunoglobulin -sekventering (Ig).
Alakazam har fem hovedformål:
* Tilbyder grundlæggende funktionalitet for andre R-pakker i rammen Immcantation. Dette inkluderer gængse opgaver såsom fil-I/O, grundlæggende DNA-sekvensmanipulering og interaktion med V(D)J-segment og genannoationer * Tilbyder en R-grænseflade til interaktion med resultatet af pRESTO- og Change-O-værktøjspakkerne * Udfører afstamningsrekonstruktion på klonale populationer af Ig- sekvenser og analyserer topologien af de resulterende afstamningstræer * Udførelse af klonal overflods- og diversitetsanalyse på lymfocyt- repertoirer * Udførelse af fysisk-kemiske egenskabsanalyser af lymfocytreceptor- sekvenser
Other Packages Related to r-cran-alakazam
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.4)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
-
- dep: r-base-core (>= 4.0.4-1)
- GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
-
- dep: r-bioc-biostrings
- GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser
-
- dep: r-bioc-genomicalignments
- Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger
-
- dep: r-bioc-iranges
- GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller
-
- dep: r-cran-airr
- GNU R AIRR-datarepræsentation - referencebibliotek
-
- dep: r-cran-ape
- GNU R-pakke for Analyses of Phylogenetics and Evolution
-
- dep: r-cran-dplyr (>= 1.0)
- GNU R-grammatik for datamanipulering
-
- dep: r-cran-ggplot2 (>= 3.2.0)
- Implementering af Grammar of Graphics
-
- dep: r-cran-igraph (>= 1.0.0)
- GNU R-netværksanalyse og visualisering
-
- dep: r-cran-lazyeval
- GNU R lazy (ikkestandard) evaluering
-
- dep: r-cran-matrix
- GNU R-pakke til klasser for tætte matricer og matricer med få udfald
-
- dep: r-cran-progress
- GNU R - statusbjælker for terminalen
-
- dep: r-cran-rcpp (>= 0.12.12)
- GNU R-pakke for Seamless R og C++-integration
-
- dep: r-cran-readr
- GNU R package to read rectangular text data
-
- dep: r-cran-rlang
- Funktioner for basistyper samt Core R- og »Tidyverse«-funktioner
-
- dep: r-cran-scales
- Skaler funktioner for visualisering
-
- dep: r-cran-seqinr
- GNU R-biologiske sekvenser - indhentelse og analyse
-
- dep: r-cran-stringi
- GNU R- faciliteter til behandling af tegnstrenge
-
- dep: r-cran-tibble
- GNU R - simple datarammer
-
- dep: r-cran-tidyr (>= 1.0.0)
- GNU R-pakke til nemt at rydde op i data
-
- sug: r-cran-knitr
- GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming
-
- sug: r-cran-rmarkdown
- convert R markdown documents into a variety of formats
-
- sug: r-cran-testthat
- GNU R-testpakke
Download r-cran-alakazam
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
i386 | 2,486.4 kB | 2,942.0 kB | [list of files] |