all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: python-bx  ]

Package: python3-bx (0.8.9-1)

Links for python3-bx

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package python-bx:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Bibliotek til at håndtere genomiske data og deres sammenligning

Projektet bx-python er et Python 3-bibliotek og associeret sæt af skripter til at tillade hurtig implementering af analyser på genomskala. Biblioteket indeholder en række nyttige moduler, men de specifikke styrker er:

 * Klasser til at læse og arbejde med genom-scale multiple local-
   sammenligninger (i MAF-, AXT- og LAV-formater)
 * Generisk datastruktur for indeksering af diskfiler, der indeholder
   datablokke associeret med intervaller på diverse sekvenser (brugt, for
   eksempel, til at tilbyde vilkårlig adgang til individuelle
   sammenligninger i store filer; optimeret for brug over
   netværksfilsystemer
 * Datastrukturer for arbejdet med intervaller på sekvenser
 * »Binned bitsets« der fungerer ligesom bit-tabeller i kromosomstørrelse,
   men dovent allokerer regioner og tillader store blokke for alle sæt
   eller alle ikke satte bit for kompakt lagring
 * »Intersecter« for udførelse af hurtig intersektionstest, der bevarer
   både forespørgsel og målintervaller og associeret annotation

Other Packages Related to python3-bx

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download python3-bx

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
i386 1,890.6 kB4,710.0 kB [list of files]