[ Source: fastqc ]
Package: fastqc (0.11.9+dfsg-4)
Links for fastqc
Debian Resources:
Download Source Package fastqc:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Olivier Sallou (QA Page)
External Resources:
- Homepage [www.bioinformatics.babraham.ac.uk]
Similar packages:
Kvalitetskontrol for høj gennemløb af sekvensdata
FastQC forsøger at tilbyde en simpel måde at udføre lidt kvalitetskontrol på rå sekvensdata, der kommer fra sekvensdatakanaler med høj gennemløb. Programmet tilbyder et modulsæt af analyser, som du kan bruge til et hurtigt indtryk af om dine data har nogle problemer, som du skal være opmærksom på før du udfører yderligere analyse.
Hovedfunktionerne i FastQc er
* Import af data fra BAM-, SAM- eller FastQ-filer (alle varianter) * Tilbyder et hurtigt overblik som fortæller dig i hvilke områder, der kan være problemer * Referatgrafer og tabeller til hurtigt at tilgå dine data * Eksport af resultater til en HTML-baseret permanent rapport * Operation uden internet til automatiseret oprettelse af rapporter uden at køre det interaktive program
Other Packages Related to fastqc
|
|
|
|
-
- dep: default-jre
- Standardjava eller Javakompatibel kørselstid
-
- dep: libcommons-math3-java
- Java lightweight mathematics and statistics components
-
- dep: libfindbin-libs-perl
- Perlmodul til at bruge en relativ sti for lib-mapper
-
- dep: libhtsjdk-java
- Java API for høj-gennemløbs sekventeringsdata (HTS) - formater
-
- dep: libjbzip2-java
- Bzip2-kompression/dekompression - bibliotek
-
- dep: libsis-jhdf5-java
- Nemt anvendeligt HDF-bibliotek for Java
Download fastqc
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
all | 380.6 kB | 564.0 kB | [list of files] |