Package: beast-mcmc (1.10.4+dfsg-2)

[ Source: beast-mcmc  ]

Bayesiansk MCMC-fylogenetisk inferens

BEAST er et program til bayesiansk MCMC-analyse af molekylære sekvenser udviklet til flere platforme. Det er orienteret mod rodfæstede, tidsmålte fylogenier udledt ved hjælp af strenge eller afslappede molekylære urmodeller. Det kan anvendes som en fremgangsmåde til at rekonstruere fylogenier men er også en ramme til afprøvning af evolutionære hypoteser uden konditionering på en enkelt trætopologi. BEAST bruger MCMC til at lave et gennemsnit over træplads, således at hvert træ er vægtet proportional med dens senere sandsynlighed. Inkluderet er en simpel brugerflade til opsætning af standardanalyser og en række programmer til at analysere resultaterne.

Other Packages Related to beast-mcmc

• dep: default-jre

  Standardjava eller Javakompatibel kørselstid

  or java6-runtime

  virtual package provided by default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre

• dep: junit4

  Rammeværktøj for JUnit-regressionstest for Java

• dep: libcolt-free-java

  scalable scientific and technical computing in Java

• dep: libcommons-math-java

  Java lightweight mathematics and statistics components

• dep: libhmsbeagle-java (>= 3.1.2~)

  Højtydende bibliotek for bayesiansk og Maximum Likelihood-fylogeni - Java

• dep: libitext1-java

  Javabibliotek til at oprette PDF uden videre

• dep: libjam-java

  Javaprogrammer ser ud og opfører sig som standardprogrammer

• dep: libjdom1-java

  lightweight and fast library using XML

• dep: libjebl2-java

  Java Evolutionary Biology-bibliotek

• dep: libmpj-java

  Javabibliotek for parallelle programmer for processorer med flere kerner og klynger

• dep: libmtj-java

  Java library for developing numerical applications

• dep: libnetlib-java

  collection of mission-critical software components for linear algebra systems

• dep: libnucleotidelikelihoodcore0 (<< 1.10.4+dfsg-2.1~)

  implementation of LikelihoodCore for nucleotides used by beast-mcmc

  dep: libnucleotidelikelihoodcore0 (>= 1.10.4+dfsg-2)

Download beast-mcmc

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	5,566.3 kB	10,810.0 kB	[list of files]