Package: theseus (3.3.0-9)

[ Source: theseus  ]

Overlejring af makromolekyler med brug af maksimal sandsynlighed

Theseus er et program, som simultant overlejrer flere makromolekylære strukturer. Theseus finder den optimale løsning til superpositionsproblemet med brug af metoden for maksimal sandsynlighed. Ved at nedvægte variable regioner af superpositionen og ved at rette for korrelationer mellem atomer, fremstiller ML-superpositionsmetoden meget præcise strukturelle sammenligninger.

Når makromolekyler med forskellige sekvenser bliver overlejret, fjerner andre programmer og algoritmer rester som er sammenlignet med huller. Theseus, derimod, bruger en ny superimpositionsalgoritme som inkluderer alle data.

Tags: Biology: Proteins, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Implemented in: C, User Interface: interface::commandline, role::program, Purpose: Analysing, use::comparing, works-with-format::plaintext

Other Packages Related to theseus

• dep: clustalo

  Alment sekvenssammenligningsprogram for proteiner

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgsl25 (>= 2.6)

  GNU Scientific Library (GSL) - bibliotekspakke

• dep: muscle

  Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser

• sug: clustalw

  Global nukleotid eller peptid sekvensjustering

• sug: dialign

  Segmentbaseret flersekvensjustering

• sug: kalign

  Global og progressiv flersekvensjustering

• sug: mafft

  Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser

• sug: probcons

  Flersekvens-sammenstilling baseret på probabilistisk konsistens (PROBabilistic CONSistency)

• sug: t-coffee

  Flersekvensjustering

• sug: theseus-examples

  Overlejring af makromolekyler med brug af maksimal sandsynlighed - eks.

Download theseus

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armel	283.3 kB	821.0 kB	[list of files]