[ Source: maffilter ]
Package: maffilter-examples (1.3.1+dfsg-2)
Links for maffilter-examples
Debian Resources:
Download Source Package maffilter:
- [maffilter_1.3.1+dfsg-2.dsc]
- [maffilter_1.3.1+dfsg.orig.tar.xz]
- [maffilter_1.3.1+dfsg-2.debian.tar.xz]
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Andreas Tille (QA Page)
- Julien Dutheil (QA Page)
- Pranav Ballaney (QA Page)
External Resources:
- Homepage [jydu.github.io]
Similar packages:
Behandl genomsammenligning i Multiple Alignment Format - dataeksempler
MafFilter anvender en serie af »filtre« på en MAF-fil, for at rense den, udtrække data og computerstatistik mens der holdes styr på de associerede metadata såsom genomkoordinater og kvalitetsbedømmelser.
* Kan behandle sammenligningen for at fjerne maskerede regioner i lav kvalitet og/eller tvetydige. * Kan eksportere data i en enkel eller flere sammenligningsfiler i et format såsom Fasta eller clustal. * Kan læse annotationsdata i GFF- eller GTF-format, og udtrække den tilsvarende sammenligning * Kan udføre glidende vinduesberegninger * Kan rekonstruere fylogeni/slægtsforskning sammen med genomsammenligningen. * Kan beregne statistik for populationsgenetik, såsom stedfrekvensspektrum, antallet af faste/pymorfiske steder etc.
Denne pakke tilbyder dataeksempler for maffilter.
Other Packages Related to maffilter-examples
|
|
|
|
-
- enh: maffilter
- Behandl genomsammenligning i Multiple Alignment Format
Download maffilter-examples
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
all | 77,358.0 kB | 78,842.0 kB | [list of files] |