Package: macs (2.2.7.1-3 and others)

[ Source: macs  ]

Modelbaseret analyse af ChIP-Seq på korte læsesekvenser

MACS opbygger empirisk længden af de sekventerede ChIP-fragmenter, som tenderer til at være kortere end lydbehandling eller størrelsesestimater for bibliotekskonstruktion og bruger den til at forbedre den rumlige opløsning af forudsagte bindingssteder. MACS bruger også en dynamisk Poisson-fordeling til effektivt at fange lokale skævheder i arvemassesekvensen, hvilket giver mulighed for mere følsom og robust forudsigelse. MACS sammenligner positivt til eksisterende ChIP-Seq peak-finding-algoritmer, er offentligt tilgængelig åben kildekode og kan bruges til ChIP-Seq med eller uden kontrolprøver.

Other Packages Related to macs

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-numpy

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

Download macs

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
armel	2.2.7.1-3+b2	2,301.4 kB	5,294.0 kB	[list of files]