Package: tophat-recondition (1.4-3)

[ Source: tophat-recondition  ]

Efterbrænder for TopHat-uoversatte læsninger

Tophat-recondition er en efterbrænder for TopHat-uoversatte læsninger (indeholdt i unmapped.bam), der gør dem kompatible med nedstrømsværktøjer (f.eks. Picard-programpakken, samtools, GATK) (TopHat problem #17). Omfatter også løsninger på fejl i TopHat:

 * SAM-flaget »mate is unmapped« angives ikke på enhver læsning i filen
   unmapped.bam (TopHat problem #3)
 * Den oversatte mate for en læsning (der ikke er oversat) kan mangle fra
   accepted_hits.bam, hvilket skaber en forskel mellem filen og de
   ikke oversatte læsningers flag (TopHat problem #16)

Other Packages Related to tophat-recondition

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• sug: tophat2

  Package not available

Download tophat-recondition

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	10.9 kB	36.0 kB	[list of files]