Package: r-bioc-variantannotation (1.36.0-1)

[ Source: r-bioc-variantannotation  ]

BioConductor-annotation af genetiske varianter

Denne BioConductor-pakke tilbyder R-funktioner til at annotere varianter, beregne ændring af aminosyrekodning og forudsige kodningsresultater.

Other Packages Related to r-bioc-variantannotation

• dep: libc6 (>= 2.15)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl4 (>= 7.18.0)

  nemt at bruge adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden (OpenSSL-variant)

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.12

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.27.9)

  GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor

• dep: r-bioc-biobase

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.15.3)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.57.2)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.47.3)

  BioConductor-infrastruktur for Biostrings-baserede arvemassepakker

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.31.3)

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.41.5)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.23.9)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-matrixgenerics

  S4-genriske summeringsstatistikfunktioner der fungerer på matrix-lignende objekter

• dep: r-bioc-rhtslib

  HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.99.0)

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.39.7)

  GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.19.5)

  BioConductor - assay-container

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.29.2)

  BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtuel) zlibbioc - Bioconductor-pakke

• dep: r-cran-dbi

  GNU R-pakke der tilbyder en generisk databasegrænseflade

• rec: r-bioc-snpstats

  BioCondutor - SnpMatrix- og XSnpMatrix-klasser og metoder

• rec: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

• sug: r-bioc-annotationhub

  GNU R-klient til at tilgå AnnotationHub-ressourcer

• sug: r-bioc-biocstyle

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

Download r-bioc-variantannotation

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3,419.3 kB	4,819.0 kB	[list of files]