Package: r-bioc-scater (1.18.3+ds-4)

[ Source: r-bioc-scater  ]

Enkelt-celle analyseværktøjssæt for genudtryksdata i R

En samling af værktøjer til at udføre diverse analyser af enkelt-celle RNA-seq-genudtryksdata, med et fokus på kvalitetskontrol og visualisering.

Other Packages Related to r-bioc-scater

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.12

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-bioc-biocgenerics

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocneighbors

  Nearest Neighbor Detection for Bioconductor-pakker

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor - faciliteter for parallel evulering

• dep: r-bioc-biocsingular

  Singular Value Decomposition for Bioconductor Packages

• dep: r-bioc-delayedarray

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-delayedmatrixstats

  Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-scuttle

  BioConductor enkelt-celle RNA-Seq-analyseredskaber

• dep: r-bioc-singlecellexperiment

  S4 Classes for Single Cell Data

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor - assay-container

• dep: r-cran-ggbeeswarm

  GNU R-kategorisk punktplot (violin-punkt)

• dep: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-gridextra

  GNU R-pakke med udvidelser for pakken grid

• dep: r-cran-matrix

  GNU R-pakke til klasser for tætte matricer og matricer med få udfald

• dep: r-cran-rlang

  Funktioner for basistyper samt Core R- og »Tidyverse«-funktioner

• dep: r-cran-viridis

  GNU R package for color maps from matplotlib

• rec: r-bioc-destiny

  GNU R - diffusionkort

• rec: r-bioc-dropletutils

  BioConductor-redskaber til at håndtere single-cell droplet-data

• rec: r-cran-nmf

  GNU R-ramme til at udføre ikke negativ matrix-faktorering

• rec: r-cran-pheatmap

  GNU R-pakke til at oprette smukke varmekort

• rec: r-cran-rtsne

  GNU R - T-Distributed Stochastic Neighbor Embedding via en Barnes-Hut

• rec: r-cran-testthat

  GNU R-testpakke

• rec: r-cran-uwot

  GNU R - ensartet manifold-tilnærmelse og projektion (UMAP)

• sug: r-bioc-biobase

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-biomart

  GNU R Interface til BioMart-databsaer (Ensembl, COSMIC, Wormbase og Gramene)

• sug: r-cran-cowplot

  GNU R streamlined plot theme and plot annotations for 'ggplot2'

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-robustbase

  GNU R-pakke der tilbyder grundlæggende robust-statistik

Download r-bioc-scater

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	518.9 kB	660.0 kB	[list of files]