Package: optimir (1.0-3)

[ Source: optimir  ]

Integration af genetiske varianter i miRNA-sammenligning

OptimiR er et arbejdsforløb for miRSeq-datasammenligninger. Det integerer genetisk information for at kunne vurdere påvirkningen af varianter på miRNA-udtryk.

OptimiR: En bioinformatik-datakanal designet til at registrere og kvantificere miRNA'er, isomiR'er og plymiR'er fra miRSeq-data og studere påvirkningen af variationer på polymirers udtryk.

Other Packages Related to optimir

• dep: bowtie2

  Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

• dep: cutadapt

  Rens biologiske sekvenser fra sekvenslæsninger med høj gennemløb

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-biopython

  Python 3-bibliotek for bioinformatik

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• dep: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• rec: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• rec: r-cran-gridextra

  GNU R-pakke med udvidelser for pakken grid

Download optimir

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	1,004.0 kB	7,404.0 kB	[list of files]