[ Source: qcat ]
Package: qcat-examples (1.1.0-2)
Links for qcat-examples
Debian Resources:
Download Source Package qcat:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Demultiplexing Oxford Nanopore-læsninger fra FASTQ-filer - eksempler
Qcat er et værktøj for kommandolinjen til at demultiplexe Oxford Nanopore-læsninger fra FASTQ-filer. Værktøjet accepterer basecalled FASTQ-filer og opdeler læsningerne i separate FASTQ-filer baseret på deres stregkode. Qcat gør demultiplexing-algoritmerne brugt i albacore/guppy og EPI2ME tilgængelige til brug lokalt med FASTQ-filer. I øjeblikket implementerer qcat EPI2ME-algoritmen.
Denne pakke indeholder eksempler til at teste qcat.
Other Packages Related to qcat-examples
|
|
|
|
-
- dep: python3-pytest
- Simpel, funktionsrig testning i Python 3
-
- dep: python3-pytest-cov
- py.test plugin to produce coverage reports for Python3
-
- dep: python3-pytest-runner
- Start py.test som distutils-kommando med afhængighedsopslag - Python 3.x
-
- enh: qcat
- Demultiplexing Oxford Nanopore-læsninger fra FASTQ-filer
Download qcat-examples
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 8,048.8 kB | 8,061.0 kB | [list of files] |