Package: r-bioc-nanostringqcpro (1.30.0-1)

[ Source: r-bioc-nanostringqcpro  ]

Behandling og QA for NanoString mRNA-udtryksdata

NanoStringQCPro tilbyder et sæt af kvalitetsmålinger, der kan bruges til at vurdere kvaliteten af NanoString mRNA-genudtryksdata - dvs. for at identificere outlier probes og outlier samples. Tilbyder også forskellige baggrundssubtraktion og normaliseringsfremgangsmåder for disse data. Det viser forslag for flagning af samples/probes og et nemt delbart kontrolresultat i html-kvalitet.

Other Packages Related to r-bioc-nanostringqcpro

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.26.0)

  GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.24.0)

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-org.hs.eg.db (>= 2.14.0)

  Genom-bred annotation for mennesker

• dep: r-cran-knitr (>= 1.12)

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• dep: r-cran-nmf (>= 0.20.5)

  GNU R-ramme til at udføre ikke negativ matrix-faktorering

• dep: r-cran-png (>= 0.1-7)

  GNU R-pakke til at læse og skrive PNG-billeder

• dep: r-cran-rcolorbrewer (>= 1.0-5)

  GNU R-pakke der tilbyder egnede farvepaletter

• sug: r-bioc-biocstyle

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-roxygen2 (>= 4.0.1)

  in-line documentation for GNU R

• sug: r-cran-testthat

  GNU R-testpakke

Download r-bioc-nanostringqcpro

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	453.0 kB	708.0 kB	[list of files]