all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: trf  ]

Package: trf (4.09.1-6)

Links for trf

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package trf:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Find og vis tandem-gentagelser i DNA-sekvenser

En tandem-gentagelse i DNA er to eller flere tilstødende, omtrentlige kopier af et mønster af nukleotider. Tandem Repeats Finder er et program til at lokalisere og vise tandem-gentagelser i DNA-sekvenser. For at bruge programmet indsender brugeren en sekvens i FASTA-format. Det er ikke nødvendigt at angive mønsteret, mønsterets størrelse eller en hvilken som helst anden parameter. Resultatet består af to filer: en tabel med gentagelser og en sammenligningsfil. Den gentagelsestabel, der kan ses i en internetbrowser, indeholder oplysninger om hver gentagelse, herunder dets placering, størrelse, antal kopier og nukleotid indhold. Klikker du på placeringsindeksene for en af tabelposterne åbner en anden browserside, der viser en sammenligning af kopierne mod et konsensusmønster. Programmet er meget hurtigt og analyserer sekvenser i størrelsesordenen .5 Mb på få sekunder. Indsendte sekvenser kan have vilkårlig længde. Gentagelser med mønsterstørrelse i området fra 1 til 2.000 baser registreres.

Other Packages Related to trf

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download trf

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 56.9 kB167.0 kB [list of files]
arm64 52.9 kB183.0 kB [list of files]
armel 55.4 kB182.0 kB [list of files]
armhf 53.0 kB182.0 kB [list of files]
i386 55.7 kB166.0 kB [list of files]
mips64el 55.3 kB187.0 kB [list of files]
mipsel 54.7 kB186.0 kB [list of files]
ppc64el 58.0 kB183.0 kB [list of files]
s390x 53.8 kB163.0 kB [list of files]