Package: python-pyvcf-examples (0.6.8+git20170215.476169c-9)

[ Source: python-pyvcf  ]

Eksempeldata for Variant Call Format-fortolkeren (VCF) for Python

Variant Call Format (VCF) specificerer formatet for en tekstfil brugt i bioinformatik for lagring af gensekvensvariationer. Formatet er blevet udviklet med fremkomsten af genotyping i stor skala og DNA-sekventeringsprojekter, såsom 1.000 genomer-projektet.

Formålet med denne pakke er at efterligne modulet »csv« i Pythons standardbibliotek, modsat de mere fleksible serialiseringsformater såsom JSON eller YAML. »Vcf« vil forsøge at fortolke indholdet af hver post baseret på datatyperne specificeret i metainformationslinjerne - specifikt linjerne ##INFO og ##FORMAT. Hvis disse linjer mangler eller er ufuldstændige, så vil der kontrolleres mod de reserverede typer nævnt i specifikationen. Hvis det fejler, så vil det bare returnere strenge.

Denne pakke tilbyder eksempler på data til at teste Pythonmodulerne.

Other Packages Related to python-pyvcf-examples

• sug: python3-pyvcf

  virtual package provided by python3-vcf

Download python-pyvcf-examples

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	922.7 kB	985.0 kB	[list of files]