Package: r-bioc-tximport (1.26.1+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-tximport  ]

Estimater på transkriptniveau for biologisk sekventering

Importerer overflod på transkriptniveau, estimeret antal og transkriptlængder og summerer i matricer for brug med nedstrøms gen-niveau analysepakker. Gennemsnitlig transkriptlængde, vægtet med eksempel-specifik transkriptoverflodsestimater, tilbydes som en matrix, der kan bruges som en forskydning for forskellige udtryk for tællinger på genniveau.

Other Packages Related to r-bioc-tximport

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• sug: r-bioc-deseq2 (>= 1.11.6)

  R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

• sug: r-bioc-edger

  Empirisk analyse af digitale gen-udtryksdata i R

• sug: r-bioc-limma

  Lineære modeller for microarray-data

• sug: r-bioc-rhdf5

  BioConductor HDF5 interface to R

• sug: r-bioc-tximportdata

  GNU R various transcript abundance quantifiers

• sug: r-cran-jsonlite

  Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-matrix

  GNU R-pakke til klasser for tætte matricer og matricer med få udfald

• sug: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• sug: r-cran-readr (>= 0.2.2)

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R-testpakke

Download r-bioc-tximport

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	85.8 kB	150.0 kB	[list of files]