Package: python3-biom-format (2.1.12-3 and others)

[ Source: python-biom-format  ]

Biological Observation Matrix-format (BIOM) - Python 3

BIOM-filformatet (kanonisk udtalt biome) er designet til at være et alment format for repræsentation af biologisk prøve efter observationsuforudsete tabeller. BIOM er en anerkendt standard for Earth Microbiome Project og er et Genomics Standards Consortium-kandidatprojekt.

BIOM-formatet er designet for almen brug i brede områder for komparative -omics. For eksempel i undersøgelser for marker-gene, den primære brug for dette format er at repræsentere OTU-tabeller: Observationerne i dette tilfælde er OTU'er og matrixen indeholder antal svarende til antallet af gange hver OTU observeres i hver prøve. Med hensyn til metagenom-data, vil dette format blive brugt til at repræsentere metagenome-tabeller: Observationerne i dette tilfælde kan svare til SEED-undersystemer, og matrixen vil indeholder antal svarende til antallet af gange hvert undersystem observeres i hvert metagenom. På samme måde med hensyn til genom-data kan dette format bruges til at repræsentere et sæt af genomer: observationerne i dette tilfælde kan igen tilsvare SEED-undersystemer, og antallet vil tilsvare antallet af gange hvert undersystem er observeret i hvert genom.

Denne pakke tilbyder BIOM-formatbiblioteket for Python 3-fortolkeren.

Other Packages Related to python3-biom-format

• dep: cython3

  C-udvidelser for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-click

  Omslag omkring optparse for kommandolinjeredskaber - Python 3.x

• dep: python3-h5py

  Almene Pythongrænseflader til hdf5

• dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: python3-pandas

  Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«

• dep: python3-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python 3

• sug: python-biom-format-doc

  Dokumentation for BIOM-formatet

Download python3-biom-format

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
s390x	2.1.12-3+b1	118.9 kB	730.0 kB	[list of files]