Package: murasaki-common (1.68.6-13)

[ Source: murasaki  ]

Detektionsværktøj for homologi på tværs af flere store genomer - fælles filer

Murasaki er en skalerbar og hurtig, sprog teoribaseret afsløringsværktøj for homologi på tværs af flere store genomer. Det gør det muligt at lave sammenligninger for hele genomer skalere gennem flere genomer. Understøtter ubegrænset længde gapped-seed-mønstre og unikke TF-IDF-baseret filtrering.

Murasaki er et anker-sammenligningsprogram som er

  * Ekstremt hurtigt (17 CPU-timer for et helt menneske x mus-genom (med
    40 knuder: 52 vægminutter))
  * Skalerbar (Kan arbitrært parallelliseres tværs af flere knuder ved
    hjælp af MPI. Selv en enkelt knude med 16 GB ram kan håndtere mere end
    1GBP sekvens)
  * Ubegrænset længdemønster
  * Gentag tolerant
  * Intelligent støjreduktion

Denne pakke indeholder alle filer, som er fælles for en enkel kerne murasakipakke og pakken for flere kerner murasaki-mpi.

Other Packages Related to murasaki-common

• dep: gnuplot

  Kommandolinjedrevet interaktivt grafprogram
  also a virtual package provided by gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

  or gnuplot5

  Package not available

• dep: imagemagick

  Programmer til billedmanipulering - binære filer
  also a virtual package provided by graphicsmagick-imagemagick-compat, imagemagick-6.q16

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl - grundlæggende Perlmoduler

• dep: r-cran-rocr

  GNU R-pakke til at forberede og vise ROC-kurver

• rec: libterm-readkey-perl

  Perlmodul for simpel terminalkontrol

• rec: libtext-wrapi18n-perl

  Internationaliseret erstatning for Text::Wrap

  or libtext-wrapper-perl

  Simpel rutine for orddeling

Download murasaki-common

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	141.9 kB	433.0 kB	[list of files]