Package: tiddit (3.5.2+dfsg-1)

[ Source: tiddit  ]

Strukturel variant-kald

TIDDIT er et værktøj brugt til at identificere kromosomale omlægninger ved hjælp af Mate Pair- eller Paired End-sekventeringsdata. TIDDIT identificerer intra- og inter-kromosomale translokationer, sletninger, tandem-duplikationer og inversioner ved hjælp af supplerende justeringer samt uoverensstemmende par.

TIDDIT har to analysemoduler. Sv-tilstanden, som bruges til at søge efter strukturelle varianter. Og cov-tilstand, der analyserer læsedybden af en bam-fil og opretter en dækningsrapport.

Other Packages Related to tiddit

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-joblib

  tools to provide lightweight pipelining in Python

• dep: python3-numpy

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

Download tiddit

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mipsel	201.2 kB	1,242.0 kB	[list of files]