Package: r-cran-sctransform (0.3.5-1)

[ Source: r-cran-sctransform  ]

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI-data

En normaliseringsmetode for single-cell UMI-antalsdata via en variance stabilizing-transformation. Transformationen er baseret på en negativ binomial regressionsmodel med legaliserede parametre. Som del af den samme regressionsramme tilbyder denne pakke også funktioner for rettelser i batch og datakorrektion. Se Hafemeister og Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for yderligere detaljer.

Other Packages Related to r-cran-sctransform

• dep: libblas3

  Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: liblapack3

  Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.2.1-2)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-cran-dplyr

  GNU R-grammatik for datamanipulering

• dep: r-cran-future

  R-pakke - en fremtidig API for R

• dep: r-cran-future.apply

  Anvend funktioner på elementer parallelt via futures

• dep: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-gridextra

  GNU R-pakke med udvidelser for pakken grid

• dep: r-cran-magrittr

  GNU R - operatør for fremadrettet datakanal

• dep: r-cran-mass

  GNU R-pakke med Venables og Ripleys MASS

• dep: r-cran-matrix (>= 1.5-0)

  GNU R-pakke til klasser for tætte matricer og matricer med få udfald

• dep: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

  GNU R-pakke for Seamless R og C++-integration

• dep: r-cran-rcpparmadillo

  GNU R-pakke for det Armadillo C++-lineære algebrabibliotek

• dep: r-cran-reshape2

  Fleksibelt omdanne data - en genstart af pakken reshape

• dep: r-cran-rlang

  Funktioner for basistyper samt Core R- og »Tidyverse«-funktioner

• rec: r-cran-testthat

  GNU R-testpakke

• sug: r-cran-irlba

  GNU R-hurtig afkortet SVD, PCA og symmetrisk eigendecomposition

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

Download r-cran-sctransform

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mipsel	468.0 kB	763.0 kB	[list of files]