Package: python3-freecontact (1.1-6 and others)

[ Source: python-freecontact  ]

Hurtig protein-kontaktprædiktor - binding for Python 3

FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).

FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.

En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.

Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.

Denne pakke indeholder Python 3-bindingen.

Other Packages Related to python3-freecontact

• dep: libboost-python1.74.0 (>= 1.74.0+ds1)

  biblioteket Boost.Python Library

• dep: libboost-python1.74.0-py311

  virtual package provided by libboost-python1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.32)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libfreecontact0v5 (>= 1.0.21)

  Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3 (<< 3.12)

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3.11~)

Download python3-freecontact

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
mipsel	1.1-6+b4	68.4 kB	276.0 kB	[list of files]