Package: r-cran-adegenet (2.1.10-1)

[ Source: r-cran-adegenet  ]

GNU R-undersøgende analyse af genetisk og genomdata

Værktøjssæt til at undersøge genetiske data og genomdata. Adegent tilbyder formelle (S4) klasser for lagring og håndtering af diverse genetiske data, inklusive genetiske markører med varierende ploidy og hierarkisk befolkningsstruktur (»genind«-klasse), alleler tælles efter populationer (»genpop«) og genom-dækkende SNP-data (»genlight«). Det implementerer også originale multivariate metoder (DAPC, sPCA), grafik, statistiske test, simuleringsværktøjer, afstands- og lighedsmål og flere rumlige metoder. En række af både empiriske og simulerede datasæt tilbydes også for at illustrere forskellige metoder.

Other Packages Related to r-cran-adegenet

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-cran-ade4

  GNU R-analyse af økologiske data

• dep: r-cran-ape

  GNU R-pakke for Analyses of Phylogenetics and Evolution

• dep: r-cran-boot

  GNU R-pakke for bootstrapping-funktioner fra Davison og Hinkley

• dep: r-cran-dplyr (>= 0.4.1)

  GNU R-grammatik for datamanipulering

• dep: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-igraph

  GNU R-netværksanalyse og visualisering

• dep: r-cran-mass

  GNU R-pakke med Venables og Ripleys MASS

• dep: r-cran-reshape2

  Fleksibelt omdanne data - en genstart af pakken reshape

• dep: r-cran-seqinr

  GNU R-biologiske sekvenser - indhentelse og analyse

• dep: r-cran-shiny

  GNU R-internetprogramramme

• dep: r-cran-vegan

  Fællesskabsøkologi for R

• rec: r-cran-testthat

  GNU R-testpakke

• sug: r-cran-interp

  GNU R - interpolationsmetoder

• sug: r-cran-maps

  GNU R-understøttelse for fremstilling af geografiske kort

• sug: r-cran-spdep

  GNU R-rumlig afhængighed - vægtskemaer, statistik og modeller

Download r-cran-adegenet

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	2,655.9 kB	4,843.0 kB	[list of files]