Package: lighter (1.1.2-7)

[ Source: lighter  ]

Hurtig og hukommelseseffektiv program til rettelse af sekventeringsfejl

Lighter er et hurtigt, hukommelseseffektivt værktøj til at rette sekventeringsfejl. Lighter undgår at tælle k-mers. I stedet bruger programmet et par af Bloomfiltrene, et af disse indeholder et eksempel på k-mers og det andet indeholder k-mers der sandsynligvis skal korrigeres. Så længe at samplingdelen bliver justeret i omvendt proportion til dybden af sekventeringen, så kan Bloom-filterstørrelsen holdes konstant, mens der bevares en næsten konstant præcision. Lighter er et parallelt program, bruger intet sekundært lager og er både hurtigere og mere hukommelseseffektiv end konkurrende fremgangsmåder, mens der opnås en sammenlignelig præcision.

Other Packages Related to lighter

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download lighter

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	48.8 kB	182.0 kB	[list of files]