Package: igv (2.16.0+dfsg-1)

[ Source: igv  ]

Integrative Genomics Viewer

Integrative Genomics Viewer (IGV) er en højtydende fremviser, der effektivt håndterer store hererogene datasæt, mens der samtidig tilbydes en intuitiv brugeroplevelse på alle niveauer af genomopslag. Et nøglekarakteristika for IGV er dets fokus på den integrerede natur i genomstudier, med understøttelse for både tabelbaserede og næste generation-sekventeringsdata samt integrationen af kliniske og fænotypiske data. Selvom IGV ofte bruges til at vise genomiske data fra offentlige kilder, så er dets primære mål at understøtte forskere, der ønsker at visualisere og udforske deres egne datasæt eller dem fra kollegaer. Til den brug understøtter IGV fleksibel indlæsning af lokale og eksterne datasæt, og er optimeret til at tilbyde højtydende datavisualisering og udforskning på skrivebordssystemer.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::java, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, network::client, Network Protocol: HTTP, Role: Program, Scope: scope::utility, use::viewing, Works with: Biological Sequence, X Window System: Application

Other Packages Related to igv

• dep: default-jre

  Standard Java or Java compatible Runtime

• dep: libbatik-java

  xml.apache.org SVG-bibliotek

• dep: libcommons-io-java

  Gængse og nyttige IO-relaterede klasser

• dep: libcommons-lang3-java

  Apache Commons Lang - redskabsklasser

• dep: libcommons-math3-java

  Java lightweight mathematics and statistics components

• dep: libdsiutils-java

  Java library of statistical and text data handling tools

• dep: libfastutil-java

  Java API providing type-specific maps, sets, lists and queues

• dep: libgoogle-gson-java

  Converts Java objects into their JSON representation

• dep: libguava-java

  Suite of Google common libraries for Java

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for høj-gennemløbs sekventeringsdata (HTS) - formater

• dep: libicb-utils-java

  Java library of utilities to manage files and compute statistics

• dep: libjide-oss-java

  extensible Swing component library for Java

• dep: libjsap-java

  Java Simple Argument Parser

• dep: liblog4j1.2-java

  Logbibliotek for java

• dep: liblog4j2-java

  Apache Log4j - Logging Framework for Java

• dep: libnb-absolutelayout-java

  Java LayoutMananger til at tillade placering i absolutte positioner

• dep: libprotobuf-java

  Javabindinger for protokolbuffere

• dep: libswing-layout-java

  Extensions to Swing layout

• dep: libxml-commons-external-java

  XML Commons eksterne kode - DOM, SAX og JAXP etc.

• rec: libmariadb-java

  Javadatabasedriver for MariaDB og MySQL

Download igv

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	3,201.0 kB	3,525.0 kB	[list of files]