Package: velvet-long (1.2.10+dfsg1-8)
Links for velvet-long
Debian Resources:
Download Source Package velvet:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Sekvens-assembler for nukleinsyre til meget korte læsninger - lang version
Velvet er en »de novo«-genomisk assembler som er specielt designet for teknologier til kort læsning, såsom Solexa eller 454, udviklet af Daniel Zerbino og Ewan Birney ved European Bioinformatics Institue (EMBL-EBI), nær Cambridge, i Storbritannien.
Velvet kan i øjeblikket tage korte læsesekvenser, fjerner fejl og fremstiller dernæst unikke »contig'er« i høj kvalitet. Det anvender derefter parvis læseinformation, hvis tilgængelig, til at indhente de gentagne områder mellem contig'erne.
Denne pakke installerer specielle long-mode-versioner af Velvet, som anbefalet i Velvetøvelserne.
Other Packages Related to velvet-long
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: velvet
- Sekvens-assembler for nukleinsyre til meget korte læsninger
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download velvet-long
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
i386 | 237.8 kB | 2,344.0 kB | [list of files] |