[ Source: qcat ]
Package: qcat (1.1.0-6)
Links for qcat
Debian Resources:
Download Source Package qcat:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Demultiplexing Oxford Nanopore-læsninger fra FASTQ-filer
Qcat er et værktøj for kommandolinjen til at demultiplexe Oxford Nanopore-læsninger fra FASTQ-filer. Værktøjet accepterer basecalled FASTQ-filer og opdeler læsningerne i separate FASTQ-filer baseret på deres stregkode. Qcat gør demultiplexing-algoritmerne brugt i albacore/guppy og EPI2ME tilgængelige til brug lokalt med FASTQ-filer. I øjeblikket implementerer qcat EPI2ME-algoritmen.
Other Packages Related to qcat
|
|
|
|
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-biopython
- Python 3-bibliotek for bioinformatik
-
- dep: python3-parasail
- Python 3-bindinger for parasail C-biblioteket
-
- dep: python3-six
- Python 2- og 3-kompatibilitetsbibliotek
-
- dep: python3-yaml
- YAML-fortolker og udleder for Python 3
-
- sug: qcat-examples
- Demultiplexing Oxford Nanopore-læsninger fra FASTQ-filer - eksempler
Download qcat
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 30.5 kB | 269.0 kB | [list of files] |