Package: autodock (4.2.6-9)

[ Source: autodocksuite  ]

Analyse af ligand-binding til proteinstruktur

AutoDock er en iøjnefaldende repræsentation for programmer der adresserer simuleringen af dokningen af ret små kemiske ligander til ret så store proteinreceptorer. Tidligere versioner havde hele fleksibiliteten i liganderne mens proteinet blev holdt ret så rigidt. Denne seneste version 4 tillader også fleksibilitet for valgte sidekæder for overfladeefterladenskaber, dvs., tage rotamerne i betragtning.

Programmet AutoDock udfører dokning af liganden til et gittersæt der beskriver målproteinet. AutoGrid forhåndsberegner disse gitre.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, works-with-format::TODO, Works with: 3D Model, Need an extra tag

Other Packages Related to autodock

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• sug: autogrid

  Beregn på forhånd liganders binding til deres receptor

Download autodock

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	161.5 kB	411.0 kB	[list of files]