[ Source: augur ]
Package: augur (20.0.0-1)
Links for augur
Debian Resources:
Download Source Package augur:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Datakanalkomponenter for realtids viraanalyse
Projektet nextstrain er et forsøg på at lave fleksible informatik-datakanaler og visualiseringsværktøjer til at registrere igangværende patogenevolution mens sekvensdata sammenføjes. Projektet nextstrain er afledt af nextflu, som var specifik for influenza-evolution.
Nextstrain består af tre komponenter:
* fauna: database og IO-skripter for sekvens- og serologiske data * augur: informatikdatakanaler til at udføre slutninger fra rå data * auspice: internetprogram til at visualisere medfølgende slutninger
Other Packages Related to augur
|
|
|
|
-
- dep: fasttree
- Fylogenetiske træer fra opstillinger af nukleotid- eller proteinsekvenser
-
- dep: mafft
- Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-bcbio-gff
- Python 3-bibliotek til at læse og skrive Generic Feature Format
-
- dep: python3-biopython
- Python 3-bibliotek for bioinformatik
-
- dep: python3-boto3
- Pythongrænseflade til Amazons nettjenester - Python 3.x
-
- dep: python3-cvxopt
- Python 3-pakke for konveks optimering
-
- dep: python3-dendropy
- DendroPy Phylogenetic Computing Library - Python 3
-
- dep: python3-ipdb
- IPython-baseret pdb-erstatning - Python 3-version
-
- dep: python3-isodate
- ISO 8601 dato/tid/varighedsfortolker og formateringsprogram - Python 3-modul
-
- dep: python3-jsonschema
- An(other) implementation of JSON Schema (Draft 3, 4, 6, 7)
-
- dep: python3-matplotlib
- Pythonbaseret plotsystem i en stil svarende til Matlab - Python 3
-
- dep: python3-networkx
- Værktøj til at oprette, manipulere og studere komplekse netværk - Python 3
-
- dep: python3-numpy
- Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
-
- dep: python3-packaging
- Grundlæggende redskaber for Python 3-pakker
-
- dep: python3-pandas
- Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«
-
- dep: python3-pyfastx
- Hurtig vilkårlig adgang til sekvenser fra FASTA/Q-fil - Python 3-modul
-
- dep: python3-schedule
- Jobplanlægning for mennesker - Python 3
-
- dep: python3-scipy
- Videnskabelige værktøjer for Python 3
-
- dep: python3-seaborn
- Statistisk visualiseringsbibliotek for Python 3
-
- dep: python3-treetime (>= 0.9.4)
- Inferens af tidsstemplede fylogenier og forfædres rekonstruktion - Python 3
-
- dep: python3-xopen (>= 1.7.0-1~)
- Python3 module to open compressed files transparently
-
- dep: python3-zstandard
- Pythonbindinger for en grænseflade med Zstandard-biblioteket
-
- dep: raxml
- Randomized Axelerated Maximum Likelihood for pylogenetiske træer
-
- dep: seqmagick
- Imagemagick-lignende brugerflade til Biopython SeqIO
-
- dep: vcftools
- Samling af værktøjer til arbejdet med VCF-filer
-
- rec: iqtree
- Effektivt fylogenetisk program ved maksimal sandsynlighed
Download augur
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
all | 182.9 kB | 829.0 kB | [list of files] |