Package: bio-tradis (1.4.5+dfsg2-1)

[ Source: bio-tradis  ]

Analyser resultatet fra TraDIS-analyser med genomsekvenser

Bio-Tradis indeholder et værktøjssæt til at analysere resultatet fra TraDIS-analyser.

Bio-Tradis-analysedatakanalen er implementeret som et Perlbibliotek, der kan udvides og enten kan bruges direkte eller som grundlag for udviklingen af mere avancerede analyseværktøjer.

Bemærk venligst: Du skal manuelt installere BioConductor Edger, som ikke kan distribueres med Debian i seneste version, da programmet anvender kode-locfit, som ikke frit kan distribueres.

Other Packages Related to bio-tradis

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl - grundlæggende Perlmoduler

• dep: libexception-class-perl

  Modul som giver dig mulighed for at deklarere reelle undtagelsesklasser i Perl

• dep: libmoose-perl

  Moderne objektsystemramme for Perl

• dep: libtext-csv-perl

  comma-separated values manipulator (using XS or PurePerl)

• dep: libtry-tiny-perl

  modul der tilbyder minimalistisk try/catch

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

• dep: r-base-core

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-cran-getopt

  GNU R-pakke der tilbyder funktionalitet på kommandolinjen til fortolkning

• dep: r-cran-mass

  GNU R-pakke med Venables og Ripleys MASS

• dep: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• dep: smalt

  Værktøj til sekvensoversættelse og sammenligning

• dep: tabix

  Generisk indeksprogram for TAB-afgrænsede arvemassepositionsfiler

• sug: artemis

  Arvemassebrowser og annotationsværktøj

• sug: r-bioc-edger

  Empirisk analyse af digitale gen-udtryksdata i R

Download bio-tradis

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	84.8 kB	245.0 kB	[list of files]