[ Source: tophat-recondition ]
Package: tophat-recondition (1.4-3)
Links for tophat-recondition
Debian Resources:
Download Source Package tophat-recondition:
- [tophat-recondition_1.4-3.dsc]
- [tophat-recondition_1.4.orig.tar.gz]
- [tophat-recondition_1.4-3.debian.tar.xz]
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Efterbrænder for TopHat-uoversatte læsninger
Tophat-recondition er en efterbrænder for TopHat-uoversatte læsninger (indeholdt i unmapped.bam), der gør dem kompatible med nedstrømsværktøjer (f.eks. Picard-programpakken, samtools, GATK) (TopHat problem #17). Omfatter også løsninger på fejl i TopHat:
* SAM-flaget »mate is unmapped« angives ikke på enhver læsning i filen unmapped.bam (TopHat problem #3) * Den oversatte mate for en læsning (der ikke er oversat) kan mangle fra accepted_hits.bam, hvilket skaber en forskel mellem filen og de ikke oversatte læsningers flag (TopHat problem #16)
Other Packages Related to tophat-recondition
|
|
|
|
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- sug: tophat2
- Package not available
Download tophat-recondition
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 10.9 kB | 36.0 kB | [list of files] |