Package: python3-cyvcf2 (0.30.18-1 and others)

[ Source: cyvcf2  ]

VCF-fortolker baseret på htslib - Python 3

Dette modul tillader hurtig fortolkning af VCF og BCF inklusive regionsforespørgsler med Python. Dette er essentielt for effektiv analyse af nukleotid variation med Python på sekventeringsdata med høj-gennemløb.

Cyvcf2 er et cython-omslag omkring htslib. Attributter som variant.gt_ref_depths returnerer en numpy-tabel direkte, så de er direkte klar til brug.

Denne pakke installerer biblioteket for Python 3.

Other Packages Related to python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-click

  Omslag omkring optparse for kommandolinjeredskaber - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  Farvelagt terminal for Python 3's logningsmodul

• dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

Download python3-cyvcf2

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
armel	0.30.18-1+b2	753.1 kB	4,624.0 kB	[list of files]