Package: insilicoseq (1.5.4-6)

[ Source: insilicoseq  ]

Sekventeringssimulator der fremstiller realistiske Illumina-læsninger

Primært lavet for simulering af metagenomiske prøver; kan også bruges til at fremstille sekventeringsdata fra et enkelt genom.

InSilicoSeq er skrevet i Python, og bruger kernetæthedsestimatorer til at modellere læsningens kvalitet af reelle sekventeringsdata.

InSilicoSeq understøtter erstatning, indsættelse og sletning af fejl. Hvis du ikke har brug for indsættelse og sletning af fejl tilbydes en grundlæggende fejlmodel.

Other Packages Related to insilicoseq

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-biopython

  Python 3-bibliotek for bioinformatik

• dep: python3-future

  Simpel single-source-understøttelse for Python 3 og 2 - Python 3.x

• dep: python3-joblib

  tools to provide lightweight pipelining in Python

• dep: python3-numpy

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• dep: python3-requests

  Elegant og simpelt HTTP-bibliotek for Python3, bygget for mennesker

• dep: python3-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python 3

Download insilicoseq

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	1,435.4 kB	1,609.0 kB	[list of files]