Package: hts-nim-tools (0.2.1-1)

[ Source: hts-nim-tools  ]

Værktøjer til biologiske sekvenser: bam-filter, count-reads, vcf-check

Denne pakke tilbyder flere værktøjer, der (i det mindste på tidspunktet for deres oprettelse) tilbyder funktionaliteter udover rutinen tilbudt af samtools og andre omvendte afhængigheder af htslib.

Disse nye værktøjer er

 * bam-filter : filtrer BAM/CRAM/SAM-filer med et simpelt udtrykssprog
 * count-reads: tæl BAM/CRAM-læsninger i regioner givet en BED-fil
 * vcf-check  : tjek regioner for en VCF mod en baggrund for manglende dele

Og ja, som navnet foreslår, er disse værktøjer alle implementeret i nim, via omslaget nim-hts (opstrøm: hts-nim) for htslib.

Other Packages Related to hts-nim-tools

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: nim-hts-dev

  Omslag for hts C-bibliotek

Download hts-nim-tools

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armel	182.9 kB	832.0 kB	[list of files]