Package: pdb2pqr (3.5.2+dfsg-3)

Links for pdb2pqr

Debian Resources:

Download Source Package pdb2pqr:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Steffen Moeller (QA Page)
Manuel Prinz (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.poissonboltzmann.org]

Similar packages:

Præparation af proteinstrukturer for elektrostatiske beregninger

PDB2PQR er en Pythonprogrampakke, som automatiserer mange af de fælles opgaver med at forberede strukturer for kontinuum elektrostatik beregninger. Det giver således et af platformen uafhængigt værktøj til konvertering af proteinfiler i PDB-format til PQR-format. Disse opgaver omfatter:

 * Tilføjelse af et begrænset antal manglende tunge atomer til
   biomolekylære strukturer
 * Bestemmelse af sidekæde pKas
 * Placering af manglende hydrogener
 * Optimering af proteinet til gunstig hydrogenbinding
 * Tildele ladnings- og radiusparametre fra en række kraftfelter

Other Packages Related to pdb2pqr

depends

recommends

suggests

enhances

dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-numpy

Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
dep: python3-pdb2pqr

Præparation af proteinstrukturer for elektrostatiske beregninger

sug: apbs

Tilpasse Poisson-Boltzmann-problemløser

Download pdb2pqr

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	11.4 kB	32.0 kB	[list of files]