all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: barrnap  ]

Package: barrnap (0.9+dfsg-3)

Links for barrnap

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package barrnap:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Hurtig ribosomal RNA-forudsigelse

Barrnap (BAsic Rapid Ribosomal RNA Predictor) forudsiger placeringen af ribosomale RNA-gener i genomer. Programmet understøtter bakterier (5S, 23S, 16S), archaea (5S, 5,8S, 23S, 16S), mitokondrier (12S, 16S) og eukaryoter (5S, 5,8S, 28S, 18S).

Programmet anvender FASTA DNA-sekvens som inddata, og skriver GFF3 som uddata. Programmet bruger NHMMER-værktøjet som følger med HMMER 3.1 for HMM-søgning i RNA:DNA-stil. Flere tråde er understøttet, og man kan forvente nogenlunde lineære hastighedsforøgelser med flere cpu'er.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::perl, interface::commandline, Role: Program, Purpose: use::searching, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to barrnap

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download barrnap

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
all 199.4 kB1,437.0 kB [list of files]