Package: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-12 and others) [debports]

[ Source:  ]

Paralelizovaná rekonstrukce fylogenetických stromů na základě maximální věrohodnosti

TREE-PUZZLE (nové jméno PUZZLE) je interaktivní konzolový program, který obsahuje rychlý algoritmus prohledávání stromu, quartet puzzling, který umožňuje analýzu rozsáhlých datových množin a automatické přiřazení jednotlivých odhadů. TREE-PUZZLE také vypočítá pravděpodobnost maximální vzdálenosti stejně jako délku větví uživatelem určených stromů. Délku větví je možno spočítat také podle časových předpokladů. Kromě toho, TREE-PUZZLE nabízí novou metodu, pravděpodobnostní mapování, sloužící k vyšetření hypotézy interní větve bez nutnosti vypočítání celého stromu a také k vizualizaci fylogenetického obsahu a sekvenčního uspořádání.

Toto je paralelizovaná verze tree-puzzle.

Other Packages Related to tree-ppuzzle

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• dep: mpi-default-bin

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

  Package not available

Download tree-ppuzzle

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
sparc64 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-12+b1	168.1 kB	1,071.0 kB	[list of files]