Segmentové uspořádání násobných sekvencí
DIALIGN-TX je nástroj pro příkazovou řádku umožňující provádět alignmenty
několika proteinových nebo DNA sekvencí. Je to úplně přepsaná implementace
segmentového přístupu s několika vylepšeními a heuristikou, což výrazně
zvyšuje kvalitu výsledných aligmentů v porovnání s DIALIGN 2.2 a DIALIGN
T. Pro párové alignmenty používá algoritmus "řetězení fragmentů"
(fragment chaining), který upřednostňuje řetězce lokálních alignmentů s
nízkým skóre před jednotlivými fragmenty s vysokým skóre. Pro násobné
alignmenty DIALIGN-TN používá vylepšený "hladový postup" (greedy
procedure), který není tak citlivý na nepodstatné lokální podobnosti.
